行政院農業委員會動植物防疫檢疫局發布新聞稿表示，該局家畜衛生試驗所於104年1月7日屏東縣一處蛋雞場樣本中，檢出H5N2亞型禽流感病毒後，截至同年月13日止，國內已確診20處高病原性禽流感案例場，其中14場為新型H5N2亞型禽流感、6場為H5N8亞型禽流感，現由各縣市動物防疫機關執行後續撲殺作業，顯見國內高病原性禽流感擴散迅速，疫情十分嚴重。監察委員仉桂美、蔡培村認有深入瞭解之必要，於104年1月13日申請自動調查。
監委指出，監察院於101年間曾就行政院農業委員會輕忽怠慢高病原性禽流感防疫作為，且明知為高病原性禽流感卻仍通報世界動物衛生組織(OIE)為低病原性，顯有隱匿疫情因而延宕後續防疫作為等情提出糾正，並追究違失人員行政責任。本次國內再度爆發高病原性禽流感疫情，短短數日雲林縣、嘉義縣、屏東縣均有確診為高病原性禽流感案例場，疫情擴散迅速、猛烈，令人擔憂。將著手調查中央與地方政府對於本次高病原性禽流感防疫作為、聯繫機制及分工情形為何？有無輕忽或隱匿疫情致貽誤防疫先機？疫情通報機制有無落實執行？有無啟動相關聯防機制俾迅速控制疫情？監察院將從制度面與執行面深入查究，釐清相關部門有無善盡防疫責任。