2003年外交部與總統府國安會為鞏固我國於「世界貿易組織」(WTO) 之權益，執行機密外交「安亞專案」。特偵組明知案情屬極機密範疇，卻認國安會秘書長邱義仁與外交部次長高英茂係為詐騙公款、捏造此案。儘管證人與證據均對嫌疑人有利，卻仍以「貪污罪」聲押邱義仁，並起訴邱、高兩人。偵查期間並疑將實質案情及偵查結果屢屢外洩於媒體，造成輿論審判。為瞭解特偵組是否違反偵查不公開原則與觸犯國家機密保護法，及有無濫權羈押、起訴等情事？監察委員陳師孟申請自動調查。
監察委員陳師孟表示，特偵組是否於政黨輪替後因求功心切，罔顧台灣之國家利益與國際處境，將偵查結果透露媒體？是否故意無視於昭昭證據，卻執意對無辜之人濫行羈押、起訴、與上訴，致有明顯枉法濫權？實有詳予探究及瞭解之必要。