監察委員蔡崇義、蔡培村、楊美鈴及田秋堇9日提出調查報告表示，有關去（107）年8月桃園市某蛋品有限公司涉嫌販售黑心液蛋案，衛生福利部食品藥物管理署（下稱食藥署）對於業者重複違反「食品良好衛生規範準則」（GHP）行為，欠缺加嚴管理及立即處理措施，致無法遏止業者近5年內10次查核結果均違規，甚同一項目重複違規高達9次之情形，GHP查核顯無法發揮應有效益，有失政府威信，殊有未當；此外，食藥署長期忽視非屬登錄系統列管業者及非法「工廠」，私下進行液蛋產製作業之實情，竟未本於職責查核此破裂殼蛋不法處理之主要癥結，罔顧民眾飲食安全，顯有怠失。
調查報告並指出，衛生福利部應審慎檢討「液蛋製品製造業者良好衛生作業指引」關於「殺菌」處理之必要性規定，並應避免業者為達到無病原菌狀態，而違法添加殺菌劑或其他物質，應強化自法規面之管理，以確保民眾飲食安全。
另經調查委員指出，行政院農業委員會曾於102年推動以紙盤(箱)載運鮮蛋之措施，惟嗣後因業者成本考量而暫停執行，為期減少鮮蛋於運輸過程之破損率，允應重行檢討或研議其他措施，以降低後端破蛋不法利用之機率。
監察委員並強調，桃園市政府衛生局應儘速研議本事件是否屬於「特定食品安全衛生事件」，以確定檢舉者獎金額度，另現依據「食品安全衛生檢舉案件處理及獎勵辦法」第5條第2項規定所發給吹哨者20萬元獎金之裁量依據標準，亦亟待該局檢討，復該局應積極查處本事件雇主是否違反食安法第50條規定，避免寒蟬效應，喪失吹哨者立法目的。