教育部執行「發展國際一流大學及頂尖研究中心計畫」，目標定義不明確，造成大學M型化趨勢及重研究不重教學、服務的現象，顯有怠失，監察院教育及文化委員會於99年4月15日通過監委葛永光、馬秀如、馬以工所提糾正教育部案。
糾正案文指出，教育部「發展國際一流大學及頂尖研究中心計畫」，雖已達成10年內至少有1所大學躋身國際一流大學的目標（台大列入世界大學第95名），且經費補助，對提升大學研究水準確有助益，但在執行過程，卻發現四大缺失：
一、教育部該計畫之目的未清楚釐訂，且計畫期程及申請內容變更時未能適時釐清。
二、該計畫目標之定義欠明確，致影響規劃及執行成效考核。
三、計畫委員中的諮詢委員、審議委員及審查小組委員之聘任沒有一定的邏輯，領域配置不一致，部分委員出席率未達50％。
四、審議指標未具體（第1梯次），未考量不同學科之特性，且未納入學校畢業生對社會之貢獻（兩個梯次）。
提案監委馬秀如指出，監察院組專案小組開始進行調查後，各校已明顯改進花費情形，顯見監察院發揮正面影響力。