引發朝野爭議的核四發電廠停建、復建風波，外界質疑延期三次工期，大量追加預算，期盼監察院能發揮職權，導正錯誤政策；監察院於99年4月9日發布聲明指出，本院在行政院民國89年10月27日宣布停止興建核四時，即提出糾正案，要求檢討改進；目前全案仍持續關注，並未結案，監察院將適時依實際情形，行使職權。
監察院指出，行政院最近函文，同意核四廠第3度展延工期29個月。本院立即要求行政院說明展延工期原因，並查明其中是否有掩飾人員疏失責任。顯見本院仍持續作為中。
除此以外，前行政院長張俊雄於89年10月27日，宣布停止興建核四廠後，前監委黃勤鎮、李友吉、林時機、張德銘、李伸一立即組專案小組調查，經調查後，發現確有明顯違失，於當年提出糾正案，指出「經濟部未經核四廠法定預算執行單位台電公司依規定作成檢討報告，即率而主動建議行政院停建核四廠；行政院不顧其程序之瑕疵即遽而作成停建核四廠之決議，且未踐行憲法及立法院職權行使法規定之法定程序，逕自宣布停建核四廠，以致引發朝野紛爭，政局不安，並造成重大損失，均涉有違失」，因而糾正行政院與經濟部。監察院在第一時間，積極依法行使職權，採取應有作為。