監委張武修調查「我國多年國家社會發展多賴優質的人力培育，而生物醫學科技人才更是當代主要科技發展之核心；惟日前有國內14個生物醫學相關學會聯合共同聲明，指出科技部門近年雖投入大筆經費卻偏重少數特定項目，未能全面審視國內科技長期人力需求與培養，其中包括『未能保障基礎研究經費』、『未能妥善規劃博士後研究員進修發展』等；科技部門的政策是否有偏頗之虞？科技部生命科學研究發展基礎研究是否逐年下降，影響我國核心科技研發？均有深入瞭解之必要」一案，經監察院教育及文化委員會於108年12月12日通過調查報告。
張武修表示，本案科技部共有下列三項缺失應檢討改進：
一、 有關學研界專業學會質疑科技部107年度基礎研究預算說法前後不一，該部未能及時積極澄清釋明，造成國內學研界恐慌及誤會，顯有失當：107年8月23日報載（註1）略以：「……學界不滿科技部過去2年過於傾向產業端，今年又大幅刪減基礎科學研究經費，包括中華民國細胞及分子生物學學會等13個學會日前發表聯合聲明，批評科技部投入大筆經費推動AI，卻未經過專家嚴審，要求科技部重新檢討過去兩年來施政方向，……科技部則回應，今年編列基礎研究預算達262億元，比去年增加2億元，而13學會所屬的生醫領域，今年總經費也有67.8億元，比去年增加超過7億元，但由於今年生醫領域申請件數與通過件數都比去年增加，可能因此導致分配金額下滑……」。
該部嗣於同年月27日召開「力挺基礎研究與重要創新研發」記者會公布107年度投入各領域研究經費計243.6億元。惟專業學會質疑上開兩者數據歧異，認為科技部對基礎研究預算說法前後不一。觀諸科技部提出基礎研究預算金額數據前後不一，更引起學研界質疑該部以似是而非虛詞來模糊焦點誤導社會大眾等，卻始終未見該部積極澄清釋明，顯有不當。
二、 科技部107年研修多項新規範，實施後或暫緩施行，或窒礙難行後再修正，顯見該部決策過程倉促，亦未與國內學研界充分溝通，實有未盡周延之處，殊有未當：科技部107年甫公布修正「科技部補助延攬客座科技人才作業要點」即遭學研界反彈，而暫緩施行，嗣經召開諮議、座談會議廣徵建言後再修正；另設「愛因斯坦培植計畫」與「哥倫布計畫」未衡平各研究領域之差異和考量我國現況，隔年又再修正補助年齡限制等情，皆顯示該部研修多項新規範措施之決策過程倉促未盡周延，實有未洽。
三、 科技部對於基礎研究及產業應用之預算分配，允應研析我國能量與需求後，長期慎密規劃推動，並應向學研界積極溝通說明政策方向及目標，加強資訊公開透明，以避免學研界認為該部資源分配不均，過於強調產業化，造成資源浪費等諸多不滿：據學研界觀察並陳訴，科技部從106年起，將大筆經費用在推動人工智慧相關計畫上，但事前既無詳細之規劃，補助時也未經專家嚴謹審查；科技部推動特定領域及年齡層之計畫，致使許多人才培育經費遭到刪減等情。科技部107年度預算，分別經科技發展計畫先期審議刪減11.35%及立法院審議統刪9.2%，因此預算創了近十年的新低。在總經費遭刪減情形下，該部陳部長邀集各學術司以維持以往專題研究計畫經費水準及增核研究主持費為基本需求估算缺口後，由科發基金結存調整支應。整體而言，生科司107年度已使用經費50.42億元仍較106年度48.19億元增加。
綜觀國際比較，以106年為例，我國政府投入研發經費比(20%)遠低於OECD平均水平(25.1%)，亦低於韓國(21.6%)。該部目前已獨立撰提109年度基礎研究計畫，並積極爭取基礎研究經費每年穩定成長，期以逐年達到OECD國家投入平均水準之目標。該部106年度推動之「我國AI的科研戰略」，107年度預算共計約44.45億元，包含前瞻基礎建設特別預算26.15億元、5+2產業創新計畫預算8.3億元及科發基金結存支應10億元，尚未有排擠基礎研究計畫經費。而107年度推動之「愛因斯坦培植計畫」及「哥倫布計畫」係爭取前瞻基礎建設計畫特別預算，亦未排擠基礎研究計畫經費。然而科技部與學研界間看法顯然存有許多歧異，該部允應檢討改善。
註1：蘋果日報107年8月23日「不滿獨厚AI刪基礎科研經費 13學會連署嗆科技部」