據民眾陳訴，南投縣政府辦理「日月潭孔雀園土地觀光遊憩重大設施BOT案」，涉有未經諮商及取得邵族同意或參與，亦未舉行公聽會廣納意見，違反原住民族基本法第21條及促進民間參與公共建設法等相關規定，辦理環境影響評估，涉有違失。
監察院調查後指出，依據聯合國原住民族權利宣言，應保障原住民族可在傳統領域內享有自我決定文化、經濟、社會發展之內涵；另依民間參與公共建設法、原住民族基本法、環境影響評估法等意旨，認定南投縣政府辦理本件BOT案執行過程，未先行與原住民族溝通協調，且後續公聽會程序，亦未諮商取得邵族部落參與同意；另原住民族委員會也未審認原住民傳統領域，並重視兩公約國內法化之權利與相關法律之整合或競合等問題，並促請其檢討改進。
經監察院調查後，原住民族委員會已於107年6月11日公告劃設邵族原住民族土地或部落範圍，南投縣政府亦於107年6月12日通過開發單位孔雀園觀光公司所提環境影響評估審查，惟邵族民眾不滿審查結論提出訴願，經行政環境保護署認定審查結論違法，已撤銷處分，將針對該案重新進行環評審查。