「下一代幸福聯盟」及立委曾銘宗、吳志揚、賴士葆、黃昭順等人，於107年11月15日到監察院陳情，陳情內容稱：中央選舉委員會於107年10月24日公告公投案政府機關意見書後，竟違反公民投票法第17條第1項規定，於同年11月2日重行公告增補行政院意見書，嗣又違反臺北高等行政法院107年11月7日裁定，將重行公告登載於公民投票選舉公報並發放給選舉人，且拒不重製或修正公民投票選舉公報，主委及副主委均涉有違失等語。
據媒體報導，中選會於接獲最高行政法院107年11月19日駁回其抗告確定後，始於107年11月20日公告撤銷7個重行公告，並於報紙網路刊載撤銷公告及107年10月24日7個公告行政院意見書內容，登報費用花費約931萬元。
監委高鳳仙值日接受陳情後，監察院曾2次發函請中選會，中選會之查復內容顯示，中選會處理過程涉有諸多違失及爭議，因此於今日(11月26日)申請自動調查。
高鳳仙表示，調查重點包括：中選會為何違法重行公告？為何違反法院裁定登載及發送違法公報？為何拒不更正紙本公民投票選舉公報？違法行為造成多少損害？相關費用如何支應？何人應負違失或賠償責任？等。